伊吾国立国数十年，虽然国家不大，但因为地理位置特殊，积攒的财货不计其数。因此整个伊吾国的权贵阶层，无不豪奢淫逸，腐化堕落。这一次黄明辽攻破伊吾国，将伊吾国的权贵阶层清洗了一个遍，整个伊吾国的大部分财富都落到黄明辽手中。
黄明辽乃将部分财货分给部下，并允他们在伊吾安居乐业，至于剩余部分则用来经营伊吾。
按照杨广的安排，在伊吾城西南建立了新伊吾城，又建了柔远（治今新疆哈密市东南）、纳职（治今新疆哈密市西三堡）二镇。此二镇与伊吾城三面拱卫新建的新伊吾城，为其屏障。
原本朝廷对怎么安置这支西征大军并无说法，但黄明远上书杨广，开拓容易戍守难，可以长征健儿屯垦西域之地，愿意携带家属的皆允其定居新伊吾，因此新伊吾又断断续续迁来数千户人家。现在中原徭役苛刻的很，使得很多人愿意向西乞活。虽然背井离乡，路途迢迢，但至少能有条活路。
黄明远后来又断断续续偷着往新伊吾提供了约两万名青壮，都是关中、关西地区活不下去的百姓。而有了这两万名青壮，黄明辽竟然在小小的伊吾供应起近三万军队，横扫无数国家，这又是后话了。
黄明辽攻破伊吾，无论是北面的泥撅处罗可汗还是高昌王麴伯雅都没有任何反对意见。他们可不是石羔这种没见识的土鳖，大隋的强大印刻在他们的心头。若是不信，你可以去问问突厥已死的都蓝可汗和刚死的步迦可汗。
黄明辽虽只是攻破了伊吾城，踏出小小的一步，却有些打破了西域的局势。
虽然西域又多了一个强势分蛋糕的人，但毕竟是敌人也是以后的事情。而现在西域各部势力，泥撅处罗可汗和契苾哥楞、射匮可汗等各方混战，早就打出狗脑子了，众人现在都想做的便是获得大隋的支持，以击败其他势力，至于会带来的危害，那便顾不得了。
很快各方都来到伊吾，向黄明辽伸出了橄榄枝。
很快，黄明辽进入西域的影响便开始出现。
大业四年十二月，身处鄯善的西突厥吐屯设阿史那摄将以鄯善、且末等地向黄明辽投降，请求归附大隋。
阿史那摄虽控制着庞大的鄯善、且末等地，但一直被泥撅处罗可汗打压。随着泥撅处罗可汗逐渐长大，为人也越来越狠辣，阿史那摄唯恐步薛延陀部那些被杀酋长的后路，一支战战兢兢。
这一次大隋进入西域，阿史那摄看到了机会，若是投降隋人，既获得了一条大粗腿，躲避泥撅处罗可汗的打压，又能以第一个投降大隋的人获得千金马骨的待遇。思虑再三，阿史那便果断的投降大隋。
当今世上，若论大腿，还这没有谁比大隋更粗。
阿史那摄的归附，使得黄明辽平白占据了鄯善（今新疆若羌附近）、且末（今新疆且末附近），打通了南线通往葱岭以西的道路。这个时代的鄯善、且末，可不是后世贫瘠、荒芜的南疆。南疆大河且末水（车尔臣河）向东沿着且末、鄯善流入南疆第一大湖蒲昌海（罗布泊），沿途良田绿洲无数，物产丰饶，农业最是发达。
而据有这二地，黄明辽便可养活足够的兵力。
黄明辽既攻破伊吾，又新得鄯善、且末，便报之于洛阳朝廷。
杨广得信大喜，黄明辽此战，望一而得三，不仅报了伊吾国袭杀隋使之仇，还为大隋开拓西域站稳了脚跟。现在大隋在西域拥有伊吾和鄯善、且末等地，向北、向西可通达西突厥，随时威胁其腹地。向南便和河西、陇右将整个吐谷浑之地包围，稳定西陲，使关西无忧。
而且杨广还充满了野望，若是可以，大隋也能如西汉一般，攻取天山南北，越过葱岭，一直向西，建立属于自己的西域都护府，比肩汉武帝。
大隋新占三地，自是不能放弃。尤其是黄明远数次上书，要移民实边，编户齐民，永葆其地。
三地之中，鄯善、且末各有王国，几无汉人，而且还有突厥阿史那摄在此，因此大隋虽然名义占据，实际上能够经营的只有伊吾。
若是要设立都护府，还稍有不妥，而且容易引起突厥和西域诸国的敌视，得不偿失。最后黄明远建议杨广可在伊吾设置一个新的总管府，统挟西北军事。等到时机成熟之后，再设置西域都护府。
杨广深以为然。乃下令在伊吾国故地设伊吾郡，鄯善国地设鄯善郡，且末国地设且末郡。三郡之上，设西州总管府，治新伊吾城，统辖三郡军事。
黄明远又建议三郡之中，只有伊吾郡能发挥作用，实力稍弱，不能抵挡西突厥。不若将敦煌郡以归西州总管府统辖，也能使其有稳定后方。
隋朝的玉门关是在现在甘肃省瓜州县以东，因此敦煌郡三县之中的敦煌、常乐（今甘肃瓜州县东南锁阳城）皆在关外，郡治更是在最西面，以敦煌郡属西州，并无不妥。
杨广乃从之。
西州总管府的官员自然以此次西征将领为主。黄明辽授正三品金紫光禄大夫，迁西州总管府总管，领伊吾郡太守。伊吾之地，也没有什么民事，为了方便屯田，因此便以黄明辽兼之。
以李节授正四品正议大夫，为西州总管府长史；卫玄之子卫孝则为司马。
王威授左虎贲郎将；高震授从三品银青光禄大夫，为右虎贲郎将；尉迟恭、伏延旺荣分授从四品通议大夫，分任左、右虎牙郎将。
蒋允会授从五品朝散大夫，迁伊吾郡郡丞；
暴固授从四品通议大夫，迁伊吾郡郡尉；
蒙跃授从三品银青光禄大夫，迁且末郡郡尉领郡事；
秦琼授从四品通议大夫，迁鄯善郡郡尉领郡事；
二郡并无汉民，因此不设太守、郡丞，只以郡尉领之。
又命崔仁恕代为权敦煌郡太守；
黄明诚授从四品通议大夫，仍领郡尉事。
至此，整个西州之地，尽落入黄明远的手中。